21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1165 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 1322 aa  2561    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  63.64 
 
 		 1312 aa  1509    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.59 
 
 		 1371 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.31 
 
 		 1506 aa  400  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.17 
 
 		 1430 aa  380  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1345 aa  365  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.55 
 
 		 1404 aa  352  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.59 
 
 		 1435 aa  347  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1403 aa  346  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  35.03 
 
 		 1384 aa  337  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  35.03 
 
 		 1384 aa  337  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1342 aa  336  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  34.81 
 
 		 1384 aa  333  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1435 aa  333  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  33.5 
 
 		 1400 aa  321  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1435 aa  320  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  34.59 
 
 		 1408 aa  314  6.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  32.65 
 
 		 1347 aa  282  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1608 aa  236  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1672 aa  224  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 		 1299 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>