20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1058 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1058  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657355  normal  0.784499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  49.23 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3515  hypothetical protein  54.55 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3702  protein of unknown function DUF343  58 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4415  hypothetical protein  55.32 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.527065  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2390  protein of unknown function DUF343  57.45 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0302108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3299  hypothetical protein  46.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3442  hypothetical protein  56.52 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0862353  normal  0.0858474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  47.83 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  45.28 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3004  hypothetical protein  50.91 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2975  hypothetical protein  50.91 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331956  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2960  hypothetical protein  50.91 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  44.68 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  52.08 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  43.4 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  45.65 
 
 		 61 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>