19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1050 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 1608 aa  3126    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  64.27 
 
 		 1672 aa  1975    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1312 aa  247  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1322 aa  206  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1403 aa  197  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.07 
 
 		 1506 aa  197  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.63 
 
 		 1371 aa  192  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.47 
 
 		 1435 aa  191  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.56 
 
 		 1430 aa  180  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1435 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1342 aa  159  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1345 aa  155  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1435 aa  146  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  23.49 
 
 		 1384 aa  137  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  23.49 
 
 		 1384 aa  137  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  25.58 
 
 		 1384 aa  132  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.5 
 
 		 1404 aa  115  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 1408 aa  95.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  23.92 
 
 		 1347 aa  82  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>