19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4240 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4240  patatin  100 
 
 
540 aa  1086    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.579844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  27.66 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  30.99 
 
 
341 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  27.5 
 
 
324 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  29.32 
 
 
323 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  27.51 
 
 
293 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  30 
 
 
321 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  30.77 
 
 
321 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  30 
 
 
321 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  30.77 
 
 
321 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  29.65 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  30 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  30 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  30 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  30 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  30 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  27.75 
 
 
294 aa  57.4  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  30.16 
 
 
361 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.95 
 
 
343 aa  51.6  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>