19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2362 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2362  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  800    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07340  hypothetical protein  73.21 
 
 
390 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.471719  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  61.54 
 
 
369 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00270  hypothetical protein  42.52 
 
 
246 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0380  hypothetical protein  26.18 
 
 
370 aa  57  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.468235  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  30.6 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  22.05 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04880  hypothetical protein  28.5 
 
 
360 aa  53.1  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  30.3 
 
 
389 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0398  chromosome segregation ATPase-like protein  22.04 
 
 
1314 aa  50.4  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  27.59 
 
 
411 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.37 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf150  massive surface protein MspI  25.43 
 
 
2416 aa  47.8  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2199  aspartate protease family protein  25.48 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.312004  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1075  chromosome segregation ATPase-like protein  21.86 
 
 
1206 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf653  massive surface protein MspH  24.28 
 
 
2438 aa  44.3  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  31.75 
 
 
142 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1423  Peptidase M23  25.83 
 
 
461 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  20.18 
 
 
328 aa  43.1  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>