32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0711 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  100 
 
 		 155 aa  320  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  43.23 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  30.82 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  31.61 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  25.49 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  30.97 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  30.97 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  30.32 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  26.53 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  29.03 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  29.68 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  29.68 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  29.68 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  28.49 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  31.01 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  28.83 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  31.25 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  28.87 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  29.86 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  30.57 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  29.14 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  28.03 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  21.3 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  32.64 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  22.7 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  22.6 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  26.75 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  29.66 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 270 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>