40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0684 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0753  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  84.02 
 
 		 1212 bp  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000245446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3013  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  99.42 
 
 		 1284 bp  2339    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00459886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0652  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  98.68 
 
 		 1212 bp  2276    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000371199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0619  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  99.34 
 
 		 1212 bp  2339    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0924734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0657  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  99.75 
 
 		 1212 bp  2371    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0684    100 
 
 		 1212 bp  2403    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.744909999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0693  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  84.02 
 
 		 1212 bp  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000811141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0797  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  83.94 
 
 		 1212 bp  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000379586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0679  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  84.19 
 
 		 1212 bp  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000284604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1167  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  83.2 
 
 		 1212 bp  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0794765  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0739  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  84.11 
 
 		 1212 bp  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000593232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  99.26 
 
 		 1212 bp  2331    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000048334  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00590  hypothetical protein  99.01 
 
 		 1212 bp  2307    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0413207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00601  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 5)  99.01 
 
 		 1212 bp  2307    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0469925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2994  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  99.42 
 
 		 1284 bp  2347    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1198  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  80.52 
 
 		 1287 bp  442  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2952  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  78.26 
 
 		 1203 bp  240  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.01213e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3024  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  79 
 
 		 1203 bp  228  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1852  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  78.86 
 
 		 1203 bp  220  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000648798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2967  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  80.62 
 
 		 1212 bp  216  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0231173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1178  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  81.92 
 
 		 1212 bp  178  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000161512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1089  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  80.46 
 
 		 1212 bp  131  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1628  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  84.02 
 
 		 1206 bp  121  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3153  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  79.05 
 
 		 1212 bp  117  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000394609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0991  penicillin-binding protein 6  88.71 
 
 		 1176 bp  67.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  normal  0.347803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0987  penicillin-binding protein 6  88.71 
 
 		 1176 bp  67.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000020777  normal  0.0123429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1164  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  88.71 
 
 		 1173 bp  67.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1052  penicillin-binding protein 6  89.47 
 
 		 1176 bp  65.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000211862  hitchhiker  0.00154362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1330  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction C  95 
 
 		 1203 bp  63.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3153  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  87.3 
 
 		 1173 bp  61.9  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000254521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0470  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  91.49 
 
 		 1176 bp  61.9  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000348683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0982  penicillin-binding protein 5 precursor (D-alanyl-D-alanin carboxypeptidase fraction A)  83.75 
 
 		 1176 bp  56  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0851  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  89.36 
 
 		 1287 bp  54  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096897  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2873  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  87.04 
 
 		 1176 bp  52  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2939  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  88 
 
 		 1173 bp  52  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000023213  normal  0.0234348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3712  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  96.55 
 
 		 1173 bp  50.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000641261  hitchhiker  0.0005316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3321  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  85.96 
 
 		 1176 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000239349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3279  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  85.96 
 
 		 1176 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000679219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1088  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  85.96 
 
 		 1176 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000911749  hitchhiker  0.00000985574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3457  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  88.64 
 
 		 1176 bp  48.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  normal  0.0310486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>