40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0305 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  95.86 
 
 		 145 aa  284  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  93.79 
 
 		 145 aa  279  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  93.79 
 
 		 145 aa  279  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  96.97 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  58.71 
 
 		 155 aa  176  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  57.24 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  57.24 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  56.58 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  55.26 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  55.26 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  49.67 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  53.85 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  51.66 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  57.89 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  48.72 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  48.72 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  48.72 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  48.41 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  45.45 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  48.08 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  47.4 
 
 		 155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  47.4 
 
 		 155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  45.16 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  47.77 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  47.33 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  46.75 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  47.3 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  45.51 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  46.71 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  41.26 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  42.67 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  51.02 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  51.02 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  40.67 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  40.66 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  90 
 
 		 36 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1744  lysis protein  29.8 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  31.08 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  31.08 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>