17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2109 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  99.38 
 
 
162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  98.77 
 
 
162 aa  333  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  98.15 
 
 
162 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  98.15 
 
 
162 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  98.15 
 
 
162 aa  331  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  96.91 
 
 
162 aa  327  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  27.4 
 
 
135 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  30.49 
 
 
131 aa  43.9  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  27.35 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  27.35 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  28.3 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  27.35 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  32.86 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  29.27 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  25.47 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>