31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3657 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  94.52 
 
 		 1005 bp  1185    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  100 
 
 		 408 bp  807    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5853    95.66 
 
 		 783 bp  1247    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.510019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  94.78 
 
 		 957 bp  1201    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  95.43 
 
 		 945 bp  1241    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  95.3 
 
 		 945 bp  1233    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  99.87 
 
 		 768 bp  1513    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3657    100 
 
 		 921 bp  1826    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  100 
 
 		 309 bp  613  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  84.11 
 
 		 903 bp  77.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2455    83.5 
 
 		 891 bp  69.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00648259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    82.3 
 
 		 1668 bp  65.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  82.3 
 
 		 891 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  82.52 
 
 		 891 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  82.52 
 
 		 891 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  82.52 
 
 		 891 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  82.52 
 
 		 891 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  82.52 
 
 		 891 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  81.15 
 
 		 915 bp  60  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  81.15 
 
 		 915 bp  60  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  81.15 
 
 		 927 bp  60  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  91.11 
 
 		 954 bp  58  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  91.11 
 
 		 966 bp  58  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4924    91.11 
 
 		 765 bp  58  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.497677  normal  0.614966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  89.13 
 
 		 879 bp  52  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  89.13 
 
 		 879 bp  52  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  89.13 
 
 		 879 bp  52  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  80.33 
 
 		 915 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  89.13 
 
 		 879 bp  52  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  78.38 
 
 		 915 bp  50.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  88.89 
 
 		 954 bp  50.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.702519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>