28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2978 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  100 
 
 		 235 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  98.72 
 
 		 235 aa  487  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  97.87 
 
 		 235 aa  483  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  97.45 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  61.7 
 
 		 231 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  61.7 
 
 		 231 aa  311  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  61.7 
 
 		 231 aa  311  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  61.28 
 
 		 231 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  59.57 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.622505 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  59.57 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  59.57 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  59.15 
 
 		 235 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  59.15 
 
 		 235 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  59.15 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  59.31 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  58.82 
 
 		 204 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  58.82 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  58.33 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  46.2 
 
 		 234 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  41.03 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  43.48 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  22.16 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1291  hypothetical protein  25 
 
 		 573 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.836535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0603  hypothetical protein  56.76 
 
 		 37 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  24.03 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3339  hypothetical protein  31.33 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>