39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1172 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  96.75 
 
 
155 aa  300  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  93.51 
 
 
155 aa  293  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  93.51 
 
 
155 aa  293  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  89.68 
 
 
155 aa  283  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  88.96 
 
 
155 aa  276  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  88.96 
 
 
155 aa  276  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  88.24 
 
 
154 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  86.36 
 
 
157 aa  270  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  85.16 
 
 
155 aa  266  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  73.08 
 
 
155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  73.38 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  66.45 
 
 
153 aa  206  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  66.45 
 
 
153 aa  206  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  65.81 
 
 
153 aa  204  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  65.81 
 
 
153 aa  204  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  65.36 
 
 
153 aa  202  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  66.67 
 
 
153 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  61.69 
 
 
164 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  61.9 
 
 
166 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  61.9 
 
 
159 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  52.98 
 
 
153 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  72.73 
 
 
99 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  72.73 
 
 
99 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  49.36 
 
 
145 aa  140  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  48.08 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  47.77 
 
 
145 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  52.94 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  44.08 
 
 
155 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  43.95 
 
 
155 aa  120  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  47.3 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  44.06 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  44.3 
 
 
150 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  53.47 
 
 
99 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  40.14 
 
 
152 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  40.45 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  40.45 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  51.35 
 
 
36 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>