20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10041 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00737  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  706    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1788  phage major capsid protein E  98.83 
 
 		 341 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.123536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1625  phage major capsid protein E  98.83 
 
 		 341 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0260656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10041  capsid component  100 
 
 		 341 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2096  major capsid protein E  98.24 
 
 		 341 aa  693    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000203332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0892  phage major capsid protein E  61.88 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2810  phage major capsid protein E  60.53 
 
 		 342 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1291  phage major capsid protein E  60.7 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1459  phage major capsid protein E  60.7 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2223  phage major capsid protein E  57.06 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00397353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1583  phage major capsid protein E  43.12 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01983  hypothetical protein  41.64 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3125  major capsid protein E  28.24 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1654  phage major capsid protein E  27.33 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.203373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1191  major head protein  56.63 
 
 		 88 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2772  major head protein  56.63 
 
 		 88 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4918  major capsid protein E  25 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.532464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1207  hypothetical protein  23.73 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000800275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1446  hypothetical protein  28.89 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.836351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1065  major head protein  24.21 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.879478  normal  0.734081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>