39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10031 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  100 
 
 		 153 aa  309  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  309  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  98.04 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  97.39 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  98.04 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  97.39 
 
 		 153 aa  280  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  75.82 
 
 		 155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  72.9 
 
 		 155 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  72.9 
 
 		 155 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  69.87 
 
 		 154 aa  214  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  71.24 
 
 		 157 aa  213  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  69.28 
 
 		 155 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  69.28 
 
 		 155 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  66.45 
 
 		 155 aa  206  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  65.81 
 
 		 155 aa  204  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  69.03 
 
 		 155 aa  203  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  64.29 
 
 		 164 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  66.01 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  65.33 
 
 		 166 aa  190  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  65.54 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  93.81 
 
 		 99 aa  186  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  93.81 
 
 		 99 aa  186  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  59.21 
 
 		 153 aa  180  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  58.55 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  58.55 
 
 		 145 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  59.74 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  56.77 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  56.58 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  52.6 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  57.24 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  52 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  45.14 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  45.7 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  50.51 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  40 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  30.46 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  91.67 
 
 		 36 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  33.76 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  33.76 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>