38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01338 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  100 
 
 		 99 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  93.81 
 
 		 153 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  93.81 
 
 		 153 aa  186  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  93.81 
 
 		 153 aa  186  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  92.78 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  91.75 
 
 		 153 aa  182  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  91.75 
 
 		 153 aa  182  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  73.74 
 
 		 155 aa  146  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  74 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  74 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  74 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  74 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  72.73 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  73 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  72.73 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  74.49 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  71.43 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  71.43 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  72.16 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  69.7 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  68.69 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  57.14 
 
 		 153 aa  106  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  55 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  51.52 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  52.04 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  52.04 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  50.53 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  51.02 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  50 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  51 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  52 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  46 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  41.11 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  44.9 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  42 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  40.7 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  40.7 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>