19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2777 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1484  hypothetical protein  93.18 
 
 		 919 aa  1757    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0431579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2777  hypothetical protein  100 
 
 		 907 aa  1887    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0713  phage protein  38.2 
 
 		 897 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5043  phage protein  37.99 
 
 		 897 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1898  phage-like protein  37.67 
 
 		 902 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2803  putative phage-related protein  34.04 
 
 		 885 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3320  phage-like protein  32.96 
 
 		 962 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01334  hypothetical protein  34.87 
 
 		 867 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.020026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1359  phage-like protein  32.9 
 
 		 888 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37190  DNA primase-like protein  33.89 
 
 		 857 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1483  hypothetical protein  36.96 
 
 		 199 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  32.22 
 
 		 673 aa  50.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  32.56 
 
 		 640 aa  48.9  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  26.96 
 
 		 588 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  28.57 
 
 		 660 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  27.5 
 
 		 595 aa  45.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0561  KilA domain-containing protein  34.48 
 
 		 242 aa  45.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  26.92 
 
 		 417 aa  44.3  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  27.34 
 
 		 640 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>