12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1898 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1898  phage-like protein  100 
 
 		 902 aa  1867    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1359  phage-like protein  50.39 
 
 		 888 aa  863    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3320  phage-like protein  47.13 
 
 		 962 aa  865    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01334  hypothetical protein  48.29 
 
 		 867 aa  784    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.020026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2803  putative phage-related protein  47.64 
 
 		 885 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37190  DNA primase-like protein  48.32 
 
 		 857 aa  788    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1484  hypothetical protein  37.66 
 
 		 919 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0431579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2777  hypothetical protein  37.67 
 
 		 907 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0713  phage protein  33.99 
 
 		 897 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5043  phage protein  33.88 
 
 		 897 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0561  KilA domain-containing protein  34.02 
 
 		 242 aa  53.5  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  27.36 
 
 		 945 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>