More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1023 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1023  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.381645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0196  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  70 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1463  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2531  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2439  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1762  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1713  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.846652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1407  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0166318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2366  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.302955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2604  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.62411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1603  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1981  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2266  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2691  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000360853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2954  translation initiation factor IF-1  55.81 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0509  translation initiation factor 1  56.25 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0744  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  94.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  64.29 
 
 		 73 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  94.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  64.29 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2765  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.219281  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2087  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  94  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000107784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  60.27 
 
 		 73 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3132  translation initiation factor IF-1  57.65 
 
 		 87 aa  93.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  0.203192 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3557  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.177852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  62.86 
 
 		 72 aa  93.6  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  94  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2872  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0587815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1932  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 74 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000750543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  59.15 
 
 		 72 aa  93.6  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>