11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0862 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0862  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.253306  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2393  NAD-dependent DNA ligase  30.77 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3865  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.62314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  decreased coverage  0.00587684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0663  NAD-dependent DNA ligase  29.17 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000015383  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1077  NAD-dependent DNA ligase  25.67 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3053  BRCT domain protein  26.64 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2589  NAD-dependent DNA ligase  27 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2687  NAD-dependent DNA ligase  27.69 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1827  NAD-dependent DNA ligase  23.36 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  21.39 
 
 		 367 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>