More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3099 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  100 
 
 
76 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  90.79 
 
 
76 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  90.79 
 
 
76 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  83.78 
 
 
77 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  77.33 
 
 
76 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  64.47 
 
 
76 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  69.86 
 
 
76 aa  100  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  64.47 
 
 
77 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  58.67 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  58.67 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  58.67 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  65.28 
 
 
81 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  65.28 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  59.72 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  60.81 
 
 
77 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  56.58 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  63.89 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  59.46 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  63.89 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  60 
 
 
80 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  58.11 
 
 
79 aa  88.6  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  62.32 
 
 
78 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  63.38 
 
 
77 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  61.33 
 
 
79 aa  88.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  61.11 
 
 
74 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  59.46 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  64.79 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  57.33 
 
 
80 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  53.95 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  56.58 
 
 
77 aa  87.8  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  58.11 
 
 
82 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  58.11 
 
 
82 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  61.11 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  61.11 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  59.72 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  59.46 
 
 
110 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  57.33 
 
 
77 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  56.76 
 
 
78 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  56.94 
 
 
79 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  60.56 
 
 
78 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  59.72 
 
 
79 aa  86.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>