28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0363 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  58.16 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  71.11 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  51.55 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  42.05 
 
 		 88 aa  93.6  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1455  TRASH  40.96 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00129945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 793 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  32.14 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  33.33 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  32.05 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 786 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 786 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 804 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  35 
 
 		 441 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  28.74 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 1020 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  35 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 846 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  48.57 
 
 		 463 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  25.88 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 817 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 817 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2076  YHS domain protein  36.96 
 
 		 224 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000164593 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 814 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 		 841 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  28.24 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>