15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4041 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4041  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  248  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1823  hypothetical protein  87.1 
 
 
124 aa  221  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1041  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.542193  normal  0.878217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1030  hypothetical protein  31.71 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244049  normal  0.740017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1423  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000100409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3017  hypothetical protein  29.69 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3541  hypothetical protein  34.15 
 
 
313 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.29 
 
 
390 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  29.58 
 
 
230 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3376  hypothetical protein  41.18 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  26.45 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0702  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.61 
 
 
393 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0789  hypothetical protein  26.72 
 
 
291 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4924  hypothetical protein  30.28 
 
 
388 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.157261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1270  hypothetical protein  29.36 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>