15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4180 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4180  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  328  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  44.44 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  36.52 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  33.59 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  32.54 
 
 		 226 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  32.38 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  42.11 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  29.69 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1551  hypothetical protein  42.11 
 
 		 159 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.670721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1830  hypothetical protein  42.11 
 
 		 159 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  37.04 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>