27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3302 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3302  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  203  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6057  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2312  pentapeptide protein  36.36 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0828621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  34.83 
 
 		 308 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2777  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.13799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.69 
 
 		 214 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  28.28 
 
 		 308 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2224  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 		 308 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  27.27 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2429  acetyltransferase, gnat family  26.26 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.287092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  26.26 
 
 		 308 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  27.59 
 
 		 482 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 446 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  26.26 
 
 		 308 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  26.26 
 
 		 308 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  28.83 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.05 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 312 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 		 447 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  32.26 
 
 		 308 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  31.33 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  25.76 
 
 		 366 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 450 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 540 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>