12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2127 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2127  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4914  putative transcriptional regulator protein  49.75 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4826  putative transcriptional regulator protein  48.29 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5777  putative transcriptional regulator protein  38.78 
 
 		 196 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5541  putative transcriptional regulator protein  36.41 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.871085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4829  hypothetical protein  35.77 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6307  hypothetical protein  37.61 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4917  hypothetical protein  34.43 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4594  hypothetical protein  31.25 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2588  hypothetical protein  30.46 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1468  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.21 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.732817  normal  0.0198654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0899  hypothetical protein  22.84 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.260517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>