39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1349 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  42.05 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  48.15 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1455  TRASH  50.62 
 
 		 83 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00129945  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  40.91 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  44.09 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  38.1 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 		 793 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  33.33 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  28.57 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  38.89 
 
 		 441 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  27.27 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  35.37 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  53.85 
 
 		 1020 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  34.57 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0746  hypothetical protein  30 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  48.72 
 
 		 805 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0249  hypothetical protein  38.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 842 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 807 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 842 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 842 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 842 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 842 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 796 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 795 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 807 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 817 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 817 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  51.35 
 
 		 804 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 786 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 786 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  32.1 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 		 798 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 786 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  32.2 
 
 		 928 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 799 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  41.86 
 
 		 389 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3657  YHS domain-containing protein  46.15 
 
 		 213 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>