18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3113 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3113  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 610 aa  1236    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.264038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0296  hypothetical protein  23.21 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000491065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  25.35 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5525  hypothetical protein  25.65 
 
 		 483 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  25 
 
 		 678 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5126  hypothetical protein  25.79 
 
 		 492 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1401  hypothetical protein  22.84 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0100124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5121  permease  29.27 
 
 		 437 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5674  hypothetical protein  29.27 
 
 		 437 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5277  hypothetical protein  29.27 
 
 		 437 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.606684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 686 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5520  hypothetical protein  29.27 
 
 		 437 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  29.19 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5218  hypothetical protein  30.77 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 3145 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5549  hypothetical protein  28.15 
 
 		 437 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5104  permease  28.46 
 
 		 437 aa  43.9  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.479721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>