18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2824 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2824  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  740    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.404789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0394  hypothetical protein  28.62 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0373  hypothetical protein  28.62 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.601269  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0385  hypothetical protein  28.62 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  26.32 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  29.18 
 
 
397 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  26.61 
 
 
410 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  28.92 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  28.92 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  28.92 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  27.12 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  29.51 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  20.43 
 
 
333 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  20.43 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  21.8 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  20.67 
 
 
332 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  27.1 
 
 
377 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0317  hypothetical protein  24.8 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0768732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>