30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2737 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2737  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000335413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1932  hypothetical protein  35.16 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0573796 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  30.15 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  25.67 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  22.16 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  22.16 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  22.16 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  21.08 
 
 
196 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  25.9 
 
 
185 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  21.08 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  21.39 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  23.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  22.22 
 
 
179 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  24.26 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  24.26 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  21.69 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  22.73 
 
 
205 aa  45.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  23.48 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  21.16 
 
 
199 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  23.39 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2999  hypothetical protein  26.42 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  20.59 
 
 
180 aa  41.2  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  21.77 
 
 
199 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>