43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2378 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1267    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  39.44 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  40.94 
 
 		 253 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  35.15 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  27.65 
 
 		 495 aa  111  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  27.45 
 
 		 278 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  34.78 
 
 		 245 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  36.48 
 
 		 242 aa  107  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  27.72 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  34.19 
 
 		 243 aa  107  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  32.5 
 
 		 231 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  37.75 
 
 		 503 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  37.18 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  40.14 
 
 		 264 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  27.83 
 
 		 269 aa  101  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  31.58 
 
 		 245 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  31.93 
 
 		 244 aa  97.8  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  31.97 
 
 		 244 aa  96.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  34.44 
 
 		 245 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  31.56 
 
 		 244 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  34.76 
 
 		 261 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  32.23 
 
 		 244 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  31.82 
 
 		 232 aa  94.7  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  24.11 
 
 		 507 aa  94.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  31.38 
 
 		 244 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  33.71 
 
 		 262 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  31.73 
 
 		 248 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  37.41 
 
 		 230 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  32.39 
 
 		 620 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  35.42 
 
 		 263 aa  90.9  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  29.52 
 
 		 246 aa  90.5  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  26.55 
 
 		 508 aa  90.5  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  35.22 
 
 		 255 aa  89.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  34.39 
 
 		 261 aa  89  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  32.92 
 
 		 261 aa  89  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  32.52 
 
 		 244 aa  88.2  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  28.12 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  32.65 
 
 		 481 aa  83.2  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  26.45 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  35.15 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  32.72 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  25.65 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  32.03 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>