43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1412 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1412  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2837  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.34 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.34 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.69 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0062  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.37 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.51 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.07 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000370596  hitchhiker  0.000000000404856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4656  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.03 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456993  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.55 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0357938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.12 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase, putative  30.17 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000620053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.94 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.15 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.11 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.96 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0966  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.53 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00202083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0857  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.25 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.67 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_839  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.53 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00921901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.67 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.93 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.92 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.92 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.11 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1865  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.65 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.827419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.11 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.46 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.46 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.7 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.02 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.59 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.59 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.17 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.1 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.5 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.29 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.18 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1890  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.11 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00906876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.29 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.14 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.69 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.07 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>