23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1109 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  100 
 
 		 410 aa  852    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  40.98 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  23.87 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  25.65 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  25.27 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  23.55 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  24.81 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  24.46 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  20.51 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  24.76 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  20.73 
 
 		 510 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  34.29 
 
 		 476 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  22.78 
 
 		 515 aa  53.1  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  20.77 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  21.97 
 
 		 517 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  22.35 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  21.79 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  25.84 
 
 		 519 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  23.8 
 
 		 523 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  25.49 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  25.2 
 
 		 484 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  24.18 
 
 		 513 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  24.18 
 
 		 513 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>