23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0283 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2917  hypothetical protein  43.87 
 
 		 308 aa  268  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2292  hypothetical protein  26.23 
 
 		 354 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00375634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2574  hypothetical protein  26.47 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751723  normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1554  hypothetical protein  26.67 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.869352  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  24.27 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1321  hypothetical protein  29.27 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.977063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  24.66 
 
 		 398 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  24.33 
 
 		 401 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  24.66 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  27.98 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  24.61 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  24.29 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  22.74 
 
 		 403 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  23.55 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0931  hypothetical protein  24.27 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  28.1 
 
 		 403 aa  45.8  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  28.1 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  25.79 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  29.2 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  23.72 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  24.15 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>