10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_192 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  67.89 
 
 		 440 aa  141  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  65.18 
 
 		 441 aa  140  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  43.94 
 
 		 423 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  34.83 
 
 		 408 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 612 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  43.33 
 
 		 433 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  43.86 
 
 		 1197 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  39.71 
 
 		 413 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  44.19 
 
 		 465 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>