16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4349 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 
169 aa  333  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  31.71 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  32.64 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  29.33 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  26.79 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  30.4 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  34.15 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  30.23 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  24.65 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2396  rod shape-determining protein MreD  24.66 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2108  rod shape-determining protein MreD  24.66 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  33.75 
 
 
172 aa  44.3  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  26.87 
 
 
183 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  30.93 
 
 
200 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>