36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0636 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 75 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  73.13 
 
 		 68 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  68.66 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  67.69 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  67.19 
 
 		 76 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  65.67 
 
 		 72 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  59.7 
 
 		 80 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  55.71 
 
 		 74 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  55.22 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  61.29 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  53.73 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0330  hypothetical protein  44.62 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1421  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0656  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  38.03 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2853  putative transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  41.89 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  31.17 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1859  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000246644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0337  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160189  normal  0.0633386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>