More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2758 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2758  transport system permease protein  100 
 
 
350 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2418  transport system permease protein  55.52 
 
 
335 aa  252  8.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  42.81 
 
 
326 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  40.45 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  40.76 
 
 
352 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  40.13 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  40.13 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  40.13 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  40.13 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
352 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  41.54 
 
 
348 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
352 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
352 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  38.58 
 
 
338 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  38.58 
 
 
338 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  38.58 
 
 
338 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  38.58 
 
 
338 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
338 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
338 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
338 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
338 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
338 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 
321 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  38.87 
 
 
338 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  43.83 
 
 
323 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.84 
 
 
644 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  39.44 
 
 
319 aa  202  7e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  40.88 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.75 
 
 
678 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  38.33 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  37.39 
 
 
322 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  37.39 
 
 
322 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.45 
 
 
678 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  43.18 
 
 
318 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
325 aa  196  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.14 
 
 
678 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.14 
 
 
678 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.14 
 
 
678 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  38.25 
 
 
323 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.14 
 
 
678 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  31.34 
 
 
337 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  31.34 
 
 
337 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 
338 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  43.36 
 
 
353 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.24 
 
 
678 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
338 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  35.57 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 
338 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  41.72 
 
 
346 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  43.49 
 
 
346 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  40.9 
 
 
351 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.95 
 
 
332 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
338 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  34.5 
 
 
338 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  34.5 
 
 
338 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  41.27 
 
 
343 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  34.5 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  33.66 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  33.66 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  34.21 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  39.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  41.13 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  39.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  39.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  39.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  43.48 
 
 
344 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.57 
 
 
337 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  41.42 
 
 
333 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  35.35 
 
 
345 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  32.73 
 
 
328 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  34.9 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0329  transport system permease protein  37.03 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1041  transport system permease protein  41.03 
 
 
348 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
335 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  35.35 
 
 
345 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  35.35 
 
 
345 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  38.89 
 
 
333 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  35.35 
 
 
342 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
342 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  33.01 
 
 
328 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0334  iron compound ABC transporter permease  36.51 
 
 
335 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1967  transport system permease protein  42.21 
 
 
331 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0349  iron compound ABC transporter permease protein  36.51 
 
 
335 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.601637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0381  iron compound ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 
335 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  43.95 
 
 
346 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0445  iron compound ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 
335 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0328  transport system permease protein  35.78 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0318  ferrichrome transport system permease  36.19 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0507697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0396  iron compound ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 
335 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  43.27 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  34.49 
 
 
333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0321  ferrichrome transport system permease  36.19 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  40.53 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>