42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5355 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  36.87 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  36.04 
 
 		 413 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  34.82 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  32.76 
 
 		 401 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  32.11 
 
 		 369 aa  217  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  35.91 
 
 		 361 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  35.91 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  30.3 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  32.28 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  32.5 
 
 		 357 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  31.1 
 
 		 364 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  30.46 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  32.3 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  30.66 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  31.68 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  31.99 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  30.84 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  29.4 
 
 		 397 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  30.16 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  29.58 
 
 		 541 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  23.59 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  23.59 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  29.58 
 
 		 541 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  23.38 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  24.21 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  20.38 
 
 		 1354 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1098 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  23.94 
 
 		 996 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1124 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  21.21 
 
 		 595 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1144 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  23.3 
 
 		 1261 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  26.51 
 
 		 950 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1169 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  22.22 
 
 		 1428 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1161 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  24 
 
 		 1261 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1158 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1154 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1016 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  24.08 
 
 		 1151 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>