29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3931 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  100 
 
 		 177 aa  366  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  65.29 
 
 		 173 aa  240  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  40.82 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  42.36 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  38.36 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  38.51 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  33.79 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  36.91 
 
 		 155 aa  96.7  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.57 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  35.33 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  37.09 
 
 		 151 aa  94.4  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  31.58 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  29.33 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  30.67 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  31.97 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  34.13 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  26 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0925  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.540819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  30.83 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  32.28 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2082  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  31.5 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  30.71 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  27.41 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2030  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase  34.29 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0540  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  29.82 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3192  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000228819  hitchhiker  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2146  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.71 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.780111  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  25.34 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>