25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0093 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  168  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  43.04 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  43.04 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3469  hypothetical protein  46.67 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  43.59 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  40.79 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  40.79 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  40.79 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2812  hypothetical protein  38.36 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  38.1 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  41.94 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3242  hypothetical protein  41.54 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  35.8 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  30.12 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1342  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  34.67 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2010  hypothetical protein  37.18 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4860  hypothetical protein  35.53 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  32.43 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  28.95 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>