45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1356 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  100 
 
 		 73 aa  147  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2982  SlyX family protein  56.16 
 
 		 73 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.781182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0814  SlyX family protein  50.68 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  47.14 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  41.56 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  47.06 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  45.59 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2122  SlyX family protein  38.67 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  40.54 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  40.58 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  36.76 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  39.13 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  35.71 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  37.84 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2615  hypothetical protein  31.43 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0309  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  32.05 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  35.21 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  39.13 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  33.8 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  35.71 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  35.82 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  42.03 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  36.23 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  36.23 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  36.23 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000379865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1208  hypothetical protein  37.68 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00636343  normal  0.193548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0169067  normal  0.244895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000204325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0171365  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  34.33 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460894  normal  0.0210084 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0365  SlyX family protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000206998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  hitchhiker  0.000764322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000178698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0292296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01225  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  34.21 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>