24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3362 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  100 
 
 
120 aa  249  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  55.08 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  55.26 
 
 
128 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  53.51 
 
 
128 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  52.14 
 
 
124 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  52.14 
 
 
124 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  50.86 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  50 
 
 
128 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  45.13 
 
 
115 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  45.13 
 
 
115 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  45.13 
 
 
115 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  46.02 
 
 
116 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0471  hypothetical protein  36.78 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000925994  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  48.15 
 
 
715 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  26.45 
 
 
174 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  28.44 
 
 
216 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  39.29 
 
 
662 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  45.28 
 
 
671 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  36.07 
 
 
772 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2726  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316487  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2562  putative cytoplasmic protein  30.1 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2603  putative cytoplasmic protein  30.1 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2615  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  34.25 
 
 
718 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>