26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0914 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  99.9 
 
 		 1041 bp  2056    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  99.9 
 
 		 1041 bp  2056    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1041 bp  2064    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0914    100 
 
 		 2410 bp  4777    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  99.81 
 
 		 1041 bp  2048    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  88.44 
 
 		 1041 bp  157  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  88.44 
 
 		 1041 bp  157  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  88.44 
 
 		 1041 bp  157  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  88.44 
 
 		 1041 bp  157  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  88.44 
 
 		 1041 bp  157  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4368  integrase, catalytic region  92.93 
 
 		 129 bp  141  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  86.57 
 
 		 1041 bp  123  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  85.59 
 
 		 372 bp  93.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  85.59 
 
 		 372 bp  93.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0603    85.59 
 
 		 372 bp  93.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0436    85.59 
 
 		 372 bp  93.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.115653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0539    85.59 
 
 		 372 bp  93.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  85.59 
 
 		 372 bp  93.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  85.05 
 
 		 468 bp  85.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3730    91.94 
 
 		 250 bp  83.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3895  iSSod13, transposase  83.47 
 
 		 192 bp  81.8  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  81.88 
 
 		 1041 bp  81.8  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4574    84.11 
 
 		 480 bp  77.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176839  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  82.11 
 
 		 1041 bp  69.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0025    79.26 
 
 		 216 bp  63.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  86.15 
 
 		 1035 bp  58  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>