36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0161 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0161  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3594  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1704  hypothetical protein  30.19 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.412312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3416  hypothetical protein  29.19 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2186  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2129  hypothetical protein  31.21 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0346  hypothetical protein  37.78 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22064  hitchhiker  0.000122714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4452  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01920  lipidA 3-O-deacylase  27.37 
 
 		 177 aa  48.5  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0737  hypothetical protein  30.68 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0778  hypothetical protein  30.68 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0765  hypothetical protein  30.68 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1064  hypothetical protein  28.06 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2695  hypothetical protein  25.5 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0457  hypothetical protein  31.18 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4744  hypothetical protein  35.23 
 
 		 172 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179642  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3809  hypothetical protein  31.82 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0022  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5310  Lipid A 3-O-deacylase  30.68 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0203  putative signal peptide protein  30.53 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3136  hypothetical protein  31.46 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4028  signal peptide protein  26.88 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0732  hypothetical protein  31.46 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2911  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0565  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0549  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1482  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0106  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0571  hypothetical protein  31.46 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.00795396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1324  hypothetical protein  29.03 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.232671  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5636  hypothetical protein  28.41 
 
 		 135 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1824  hypothetical protein  25.86 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.482484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2700  hypothetical protein  28.72 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03145  signal peptide protein  28.42 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.561242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4145  hypothetical protein  30.85 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61650  Lipid A 3-O-deacylase  30.68 
 
 		 173 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0713933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>