18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1704 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.412312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3594  hypothetical protein  71.74 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3416  hypothetical protein  67.34 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2186  hypothetical protein  63.08 
 
 		 195 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263366  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0161  hypothetical protein  30.19 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2695  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2129  hypothetical protein  26.73 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6144  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2200  hypothetical protein  36.25 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.185923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2814  hypothetical protein  36.25 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2825  hypothetical protein  36.25 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2448  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.967354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1824  hypothetical protein  33.96 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.482484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0102  hypothetical protein  35.71 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0978  hypothetical protein  33.93 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.213047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  31.71 
 
 		 394 aa  41.2  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>