18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2186 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2186  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1704  hypothetical protein  63.08 
 
 
200 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.412312  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3594  hypothetical protein  66.09 
 
 
200 aa  234  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3416  hypothetical protein  60.51 
 
 
205 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0161  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1824  hypothetical protein  26.96 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.482484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0102  hypothetical protein  29.35 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2695  hypothetical protein  39.51 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1937  hypothetical protein  24.37 
 
 
205 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2448  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.967354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6144  hypothetical protein  34.94 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  37.5 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2129  hypothetical protein  24.37 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2874  hypothetical protein  32.1 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2732  hypothetical protein  31.71 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2200  hypothetical protein  33.73 
 
 
189 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.185923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2814  hypothetical protein  33.73 
 
 
189 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2825  hypothetical protein  33.73 
 
 
189 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>