More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0017 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0044  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0069  tRNA-Val  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0043  tRNA-Val  95.65 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00024501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  89.29 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0011  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0027  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361499  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03750  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00394114  normal  0.229582 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5725  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0853  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000111044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0527  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3227999999999999e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5633  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5709  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000949158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5050  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000188833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0170  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0237549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5145  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000184879  normal  0.692523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4774  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000014475  hitchhiker  6.83474e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5003  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0778  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34684e-29 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0272  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>