43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0475 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  427  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  55.65 
 
 
230 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  42.98 
 
 
232 aa  192  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  45.85 
 
 
507 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  44.54 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  40.79 
 
 
245 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  38.05 
 
 
243 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  39.73 
 
 
497 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  38.81 
 
 
508 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  36.4 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  36.49 
 
 
506 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  36.65 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  36.09 
 
 
503 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  33.64 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  34.67 
 
 
495 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  34.33 
 
 
245 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  34.47 
 
 
244 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  37.55 
 
 
288 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  33.64 
 
 
503 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  32.91 
 
 
244 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  34.2 
 
 
261 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  32.61 
 
 
244 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  35.37 
 
 
262 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  35.4 
 
 
261 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  32.76 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  37.04 
 
 
481 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  32.49 
 
 
255 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  34.25 
 
 
620 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  33.19 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  37.19 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  32.2 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  34.21 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  32.61 
 
 
245 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  32.47 
 
 
497 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  34.03 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  32.88 
 
 
545 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  36.1 
 
 
245 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  34.2 
 
 
264 aa  101  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  29.83 
 
 
601 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  35.96 
 
 
646 aa  95.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  32.82 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.611874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>