15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0997 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0997  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1890  hypothetical protein  47.06 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  43.08 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  39.06 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  36.62 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1553  hypothetical protein  35.82 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  39.13 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  35.71 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  35.71 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  41.54 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  38.46 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2995  hypothetical protein  32.39 
 
 
253 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  34.43 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0700  hypothetical protein  32.84 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>