26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0173 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0173  phosphopantetheinyl transferase-like protein  100 
 
 
188 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4661  phosphopantetheinyl transferase  38.98 
 
 
210 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.9 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.92 
 
 
270 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  28.32 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17312  predicted protein  34.09 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0056832  normal  0.0249037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
231 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.28 
 
 
234 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
274 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.31 
 
 
264 aa  45.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2496  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.26 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.580668  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.46 
 
 
265 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
237 aa  44.7  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
229 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.14 
 
 
251 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.36 
 
 
243 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.32 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.8 
 
 
280 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.3 
 
 
257 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.9 
 
 
226 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 
251 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.1 
 
 
238 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.1 
 
 
238 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  29.41 
 
 
272 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
233 aa  41.2  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>